Informal Essay

质谱(Mass Spectrometry, MS)与药学研究 (8)

跨界混搭新名词 学科交叉老话题 跨界(crossover)和混搭(mix and match)是当前比较流行的新名词,尤其在其进入互联网以后,被一些大V、名嘴给吹的妇孺皆知,像我等躲在角落搞研究的人,也不能豁免。罗胖子罗歪嘴整天在微信上宣扬下一代的商业模式,其核心就是通过跨界来寻找新的商机,他疯狂的把房子都卖了,以显示其对新的互联网模式的支持。每个人自有其精彩的生活方式,这不是我们关注的重点,只是其提到的跨界概念,在我们药学领域也广泛存在,今天我们就来谈谈药学领域的跨界问题。不过,在药学领域,这个不叫跨界,也不叫混搭,一般称为“学科交叉(inter-discipline)”,可以是用一个学科的技术解决另一个学科的问题,也可以是一个学科的思想启发另一个学科。本质来讲,药学就是学科交叉而来的,比如药物学与化学、物理、计算机等学科的交叉,产生了药物化学、药物分析学、药剂学、药物动力学,药物计量学等,目前,一些新出现的研究领域,更是学科交叉的典范,比如各种组学、网络药理学、计算毒理等。

质谱(Mass Spectrometry, MS)与药学研究 (7)

一锅中药惹人愁 寻得关键才无忧 前文讲到由于质谱自身关于化合物精细结构的信息有限,需借助已有标准物质建立裂解规律,才能对同类物质的未知结构进行推断。除了借助标准品的信息,中药中成分间自有的关联信息也非常有用。中药(包括药材和方剂),甚至植物药,中的成分间往往存在某种特定的关系,很少遇到仅是孤零零几个不相关成分的情况,这个特点特别适合于用质谱分析,并且鉴定的时候,不出结果则已,一出结果那就是一大串化合物同时被鉴定了。因此,找到这个一锅粥中的内在联系,将会使我们的质谱分析工作事半功倍。

质谱(Mass Spectrometry, MS)与药学研究 (6)

多少解谱心酸事 都付一三笑谈中 这个坑挖的太久了,好久没填了,真是不好意思!那今天就来点ESI质谱解析中最关键的猛料,可以这么说吧,只要掌握这一点,就掌握了质谱解析的百分之八十以上,其他的就靠自己回去偷着演练了。今天的内容相当于武功里面的“九阴真经”和“葵花宝典”!不过不需要自宫哦~

[藏书千卷不如读书一卷]基于酶和转运体的DDI研究(3)

Chapter 2 Transporters: Importance in Drug Absorption, Distribution, and Removal Introduction:transporters的分类 SLC (solute carriers, 溶质运载蛋白家族) and ABC (ATP-binding cassette, ATP结合盒转运载体) SLC有380多个成员,48个subfamilies,其中约19个gene families的转运活性已被研究,如SLCO, SLC15, SLC22, SLC47 已被鉴定的ABC转运体有7个subfamilies,49个蛋白,一些对药物有特异性,如ABCB, ABCB,and ABCG subfamilies. Tables…

能否通过单纯IV或IG计算药物体内代谢的比率呢?

问题:假定药物在体内是一室分布,通过IV或IG给药,同时测定parent和metabolite随时间变化的浓度(摩尔浓度),能否根据这些数据计算出药物代谢的比例,即有多少百分比的药物生成了代谢产物! 有人建议通过计算代谢物与原型药物峰面积的比值,来估算生成代谢物的比率。Metabolism Rate (MR%) = 100*AUC_m/(AUC_m+AUC_p)

[藏书千卷不如读书一卷]基于酶和转运体的DDI研究(2)

Chapter 1: Enzymatic Basis of Phase I and Phase II Drug Metabolism 本章综述一相和二相解毒酶,它们潜在的诱导和抑制功能,以及基因改变在DDI中的角色。 人体内的酶种类繁多,普遍存在polymorphisms;基因水平的改变会影响药物的处置和DDI,这通常被成为idiosyncratic drug reactions (特异性药物反应)。 代谢酶分为Phase I和Phase II,Phase I主要为CYP酶系,除了肝脏外,其他肠道等器官的分布也很重要; Phase II有UGTs, SULTs, GSTs and NATs. FDA批准的药物有60%是CYP酶系代谢的 Fig.1.1 为CYP450的通用代谢过程图。

[藏书千卷不如读书一卷]基于酶和转运体的DDI研究(1)

去年(2013年)我在空余时间读完了14本书,其中5本为英文原著,不过多是一些科普、宗教和小说类的书籍,今年想把自己计划阅读的书单偏重于专业书。专业书多为七八百页,甚至上千页的大部头,给自己的要求是,不仅要看,还要做好每章内容的摘要和笔记。我相信一个看法,只有用自己的话,把书中的内容写出来,才算学到了东西。第一本书,我选择的是“Enzyme- and Transporter-Based Drug–Drug Interactions”,书相当于一系列主题的综述,多是事实性的内容,有助于增加自己在DDI方面的知识面和系统性。我争取每周读一章,并摘录要点。

质谱(Mass Spectrometry, MS)与药学研究 (5)

缘何碎片质更高 反常里面藏玄妙 质谱是一门试验科学,而试验科学的精髓就是尊重试验的结果,这一点是我们搞试验人员必须时刻要牢记的。“试验”不是“实验”,你要不断的去尝试,尤其是别人没有尝试过的东西(包括动手的尝试和动脑的尝试),而不是总重复别人,如给本科生上实验课一样。如何才能体现对试验的尊重呢?!千万不要用自己已知的经验去限定未知的试验现象,这可能也是专家(这里特指那些只会吹嘘,没有实践经验的人,不要对号入座。)的思想一般都比较顽固的缘故吧。专家的头脑中有过多的思维定式,遇到问题多是从自己以往的经验去判断,如果不符合自己的经验,就会下结论“你做的试验有问题,重做!”。