Transit Compartment Model vs LAG Model (转移室模型与时滞模型)
Yufeng Zhang
有些口服药物在到达吸收部位前，在消化道内转运需要一段时间，这在PK曲线上，就会看到血药浓度在某某min以后才会开始上升。传统的处理方法（也是现在 主要药动学软件都内置的）是增加一个时滞参数TLAG。加上TLAG以后一般会得到较好的拟合结果，不过，从理论上分析，药物不能在TLAG以后，突然开 始吸收入血，肯定有个变化的过程。见下图的模拟，虚线是LAG模型，实线是TRANSIT模型：
一个用Gaussian计算溶剂中ECD光谱的方法来确定化合物绝对构型的实例
本文的例子是我们在研究鬼箭羽时发现的一个新化合物，当时其绝对构型采用经验规则与已知绝对构型的进行比较来确定的，发表在Natural Product Research上。后来，我们采用量化计算的方式，同样的确定了该化合物的绝对构型，下面详细的笔记，与诸位分享。
用NONMEM实现IV和IG数据的同时分析
学过药动的人都知道生物利用度（F）是一个非常重要的参数，其反映了机体对药物的利用程度。Wikipedia上对生物利用度（Absolute bioavailability）的解释为： In pharmacology, in order to determine absolute bioavailability of a drug, a pharmacokinetic study must be done to obtain a plasma drug concentration vs time plot for the…
质谱(Mass Spectrometry, MS)与药学研究 (5)
缘何碎片质更高 反常里面藏玄妙 质谱是一门试验科学，而试验科学的精髓就是尊重试验的结果，这一点是我们搞试验人员必须时刻要牢记的。“试验”不是“实验”，你要不断的去尝试，尤其是别人没有尝试过的东西（包括动手的尝试和动脑的尝试），而不是总重复别人，如给本科生上实验课一样。如何才能体现对试验的尊重呢？！千万不要用自己已知的经验去限定未知的试验现象，这可能也是专家（这里特指那些只会吹嘘，没有实践经验的人，不要对号入座。）的思想一般都比较顽固的缘故吧。专家的头脑中有过多的思维定式，遇到问题多是从自己以往的经验去判断，如果不符合自己的经验，就会下结论“你做的试验有问题，重做！”。
[2005-05-03]预则立，不预则废（昔日博士阶段的规划）
整理文件，看到一篇自己在2005年写的一个计划，希望在博士三年中在“内在修养、健康体魄、事业有成”三个方面有所进步。现在看来，有些东西不仅是博士三年要做的，也是我一生要继续努力的。下面红色的为自己今天的注释，其他为原版的文字，为了保持原样，错别字也没有修改。原始的文档保存在QQ收藏夹中，得以这么多年以后，还可以看到。
质谱(Mass Spectrometry, MS)与药学研究 (4)
麻烦自找自受罪，好事多磨多无果！ 早晨很早就来图书馆了，这个周末必须要把两件事做完。已经快中午了，还没有开始。碰到了Prof. M，一直聊她的事情，如果不是另一个PhD的到来，我现在估计还没有脱身。近来一些事情不断的应验，我越来越怀疑这个世界是否是真实的，难道我是在梦中吗？如果我是在梦中，那么是谁在做梦？如果是我，我又怎知是自己在做梦？如果我知自己在做梦，那么我不应该是清醒的吗？
质谱(Mass Spectrometry, MS)与药学研究 (3)
我为技术神癫狂，谁知技术害我伤！ 我有一个优点，那就是专一；我有一个缺点，就是太过专一。这个专一与“用情”无关，只是我对技术的一种崇拜状态吧。这种状态让我可以轻易学会别人不敢涉足的一些东西，从而越陷越深。曾几何时，当别人在与女友逛街，或者在游戏中苦战的时候，我却在与我的所谓技术苦恋。在丁香园骨干版有个老帖，里面有@天天 拍的一个照片，从这里可以窥见十年前的我是多么无趣的一个人，但那正是我曾经的乐趣所在。
质谱(Mass Spectrometry, MS)与药学研究 (2)
投机取巧解核磁，暗埋玄机陷深渊 上次说到我被钟老师发配到核磁室学习核磁，后来才逐渐明白这是一步棋，暗含各种权利斗争。总之，谁要把握了仪器，谁就有了发言权。举个简单的例子，我看你不顺眼，你的样品我就押后做，你不求我十次八次，别想拿到结果。你要着急，可以去其他单位做呀。只是当时单纯的自己没有觉察罢了，每天也就如上班一样，去那里报到。一开始也没有事情可做，就是站在旁边看，有人送样的话，就帮忙登记一下，或者帮他们把样品加上氘代试剂，天气冷的话，用电吹风吹吹结冰的DMSO-d6，其实就是一个打杂的。
质谱(Mass Spectrometry, MS)与药学研究 (1)
首先，我绝没有意思想写“质谱在药学研究中的应用”这样一篇综述，只是我要写的内容恰恰与质谱和药学沾点关系而已。为什么要写这些呢？也许是想给后来人一些借鉴。当然绝不是非常成功的经验，也不是很失败的经验，更像一些默默无闻的大多数吧。如果您仅对如何成为明星科学家感兴趣，可能我的经历不适合你看；我的经历更适合想混日子而已的一般人。
药物吸收评价的重大进展：Caco-2单层细胞的发现
最近要写关于Caco-2的数据分析的一篇文章，检索到一篇关于Caco-2身世的文章，不敢独享。众所周知，我们所用的绝大多数药物为口服药物，而吸收是所有口服药物开发最重要的一环。在上世纪八十年代的时候，主要有两种动物模型可用于药物的吸收评价，一种是in situ的在体肠灌流，另一种是in vitro的离体肠段。这两种模型都有一些缺点，比如非人源，操作复杂，不能重复使用，难以规模化筛选，动物伦理等。 罗纳德教授（Ronald T. Borchardt）本是一位药物化学家，就是那种搞合成的，与细胞这些生物学内容并不搭噶。在进行了12年的药化研究以后，他被委任为堪萨斯大学药学院药化系的系主任，兼任Solon E. Summerfield杰出教授。罗纳德教授当时就意识到了生物技术、细胞和分子生物药剂学的重要性，他想拓展自己的研究领域。当时的一些制药企业，逐渐意识到ADME性质对新药开发的重要性，在考虑化合物对药效靶点的亲和性和专属性时，同时考虑其ADME性质。 参考文献：The AAPS Journal, Vol. 13, No. 3, September 2011 DOI: 10.1208/s12248-011-9283-8