酶动力学的PML模型
前面我们用Excel和Matlab实现了酶动力学的参数估算方法,今天我们介绍使用药动建模工具phoenix来进行酶动力学分析。正如我们前面提到的,phoenix不支持隐式方程的求参,所以需要对数据进行一下变通,通过观察IMM方程,我们发现,虽然C0和C1之间不能用显示方程表示,但是C1和t之间的关系却可以写成显示方程,一系列的C1和对应的反应时间t我们都知道,C0可以类比于PK中的给药剂量。
Some thoughts on Mass Spectrometry and Modeling & Simulation
前面我们用Excel和Matlab实现了酶动力学的参数估算方法,今天我们介绍使用药动建模工具phoenix来进行酶动力学分析。正如我们前面提到的,phoenix不支持隐式方程的求参,所以需要对数据进行一下变通,通过观察IMM方程,我们发现,虽然C0和C1之间不能用显示方程表示,但是C1和t之间的关系却可以写成显示方程,一系列的C1和对应的反应时间t我们都知道,C0可以类比于PK中的给药剂量。
前段时间进行体内外相关性建模,遇到需用体外酶动力学参数预测体内的消除程度,在与做试验的同学讨论的时候,发现大家应用米曼方程并不注意前提条件,比如需控制反应时间或起始浓度,使反应结束时,底物的消除不要超过10%,否则计算的反应速率就与真正的起始速率有很大偏差,用这样获得的有偏差的起始速率与起始浓度求算Km和Vmax,必定难以获得真实的酶动力学参数。
Phoenix是Pharsigh开发的药动建模平台,是制药界的“Gold Standard”。Phoenix不仅可以研究药动学问题,对于“男追女”的问题研究也是神器一枚。且看我们如何用它来实现获得了2013年菠萝科学奖的论文(“男生追女生的数学模型”)中的微分模型。