紫草酸B和丹酚酸B都是丹参中提取得到含量很高的化合物，曾一度认为它们是两个不同的化合物，差别为苯丙二氢呋喃环上的两个手性碳的构型（丹酚酸B为RR，紫草酸B为SS）。不过，在2006年的时候，Ellman等在JNP上发表一篇文章（J Nat Prod. 2006 Aug;69(8):1231-3.）证明这两个化合物的手性是相同的，丹酚酸B原来的构型归属错误，有兴趣的可以看看那篇文章。
紫草酸B为四倍体，结构中的两个酯键最容易断裂。结构中含有A和B两个相同的丹参素单元，当丢失180Da时，可能是丢失A单元，也可能是丢失B单元。两条裂解途径都可以生成的离子既有相同也有不同：其中m/z 537, 519和339两种途径都可生成，它们有两种可能的结构；m/z 295和321两种裂解途径都可以生成，但结构只有一种可能；m/z 493只能通过b途径生成。最有可能是两种途径都有几率发生，图谱为两种途径综合的结果。
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化合物：Names from NCI| PubMed
分子量：718.6
分子式：C36H30O16
SMILES: C1=CC(=C(C=C1C[C@H](C(=O)O)OC(=O)/C=C/C2=C3[C@@H]([C@H](OC3=C(C=C2)O)C4=CC(=C(C=C4)O)O)C(=O)O[C@@H](CC5=CC(=C(C=C5)O)O)C(=O)O)O)O
InChIKey: SNKFFCBZYFGCQN-ZQDRKSDISA-N
参考文献：10.1002/rcm.2332
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