紫草酸B分子中有两个羧基，均可与甲醇缩合成甲酯，一个为9″-位，一个为9″‘-位。这两个异构体的质谱图中离子的种类除一个离子外基本相同，只是丢失两个丹参素单元以后的离子的丰度有很大区别。可以根据是否存在连续丢失咖啡酸180Da和44Da的两个离子，来判断甲酯所在的位点，只有甲酯在9′”-位时（A单元上的羧基），才有可能丢失44Da，明天会介绍这个异构体的裂解。
与紫草酸B相比，9″-位甲酯以后，除对应的离子质荷比增加14Da外，丢失两个丹参素单元的离子m/z 321丰度有所提高，从上图可知，a途径裂解的机会大大增加。由此推知，若先丢失A单元，则B单元也容易丢失；若先丢失B单元，A单元的丢失就比较难了。在9“-位甲酯化之前，b途径更容易发生，所以在紫草酸B的质谱图中，丢失一个丹参素单元的离子最高，同样，明天介绍的9″‘-位甲酯的丢一个单元的离子也最高。
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化合物：Names from NCI| PubMed
分子量：732.6
分子式：C37H32O16
SMILES: O=C(O)[C@@H](OC(/C=C/C1=C2[C@H](C(O[C@@H](C(OC)=O)CC3=CC(O)=C(O)C=C3)=O)[C@@H](C4=CC(O)=C(O)C=C4)OC2=C(O)C=C1)=O)CC5=CC(O)=C(O)C=C5
InChIKey: REHAMWBRZKUHPN-RTLLXKGUSA-N
参考文献：10.1002/rcm.2332
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