2013

甘草黄酮的裂解(3):甘草苷(Liquiritin)

甘草苷在正负离子模式下均发生糖苷键断裂,断裂的类型和丢失的中性碎片完全一样,见上图。这种断裂方式在ESI质谱中最常见,我在硕士论文中将这类反应称为“1,3-断裂”,即发生断裂的键为第1个(起始端)和第3个根键(末端),同时两端的基团连接起来,中间的第2根键形成双键(形成一个新键)。

甘草黄酮的裂解(2):7-O-(beta-D-apiofuranosyl-(1-2)-beta-D-glucosyl)-Liquiritigenin

今天化合物的正负离子质谱图与昨天的第一个化合物非常接近,只是离子的丰度有些差别,它们为一对同分异构体。我感觉比较奇怪的是,这两个化合物都没有看到C环开裂的产物,难道是仪器或碰撞能量的缘故?若C环开环形成查儿酮,那么其稳定性自然会有较大提高,看不到母核碎片倒可以理解。

非线性拟合的一个前提条件:观测变量等方差分布

当我想好这个题目的时候,我顺便放狗搜了一下,找到几个非常对我胃口的博客(数据科学与R语言,Yihui Xie)。在看其中文档的过程中,我曾有短暂的失落感,“我在统计方面的知识太逊了”,不过我马上意识到自己又陷入了完美主义的坑,一个人怎能那方面都那么出色呢?在统计领域,我只要知道有哪些流行技术,哪些对我现在的研究课题有帮助,或者将来有帮助即可,只要分类整理入自己的笔记即可,完全可以等到需要的时候再去学。我自己喜欢的专业才是最根本的,这个是核心,其他只是点缀而已。我的目标是,“比药学家懂统计,比统计学家懂药学”!

酶动力学的PML模型

前面我们用Excel和Matlab实现了酶动力学的参数估算方法,今天我们介绍使用药动建模工具phoenix来进行酶动力学分析。正如我们前面提到的,phoenix不支持隐式方程的求参,所以需要对数据进行一下变通,通过观察IMM方程,我们发现,虽然C0和C1之间不能用显示方程表示,但是C1和t之间的关系却可以写成显示方程,一系列的C1和对应的反应时间t我们都知道,C0可以类比于PK中的给药剂量。