MS Blog of Dr. Zhang

Some thoughts on Mass Spectrometry and Modeling & Simulation
  • About

Meta

  • Log in
  • Entries RSS
  • Comments RSS
  • WordPress.org

Recent Comments

  • Yufeng Zhang on 丹参酚酸的裂解II(5):1-O-咖啡酰葡萄糖(1-O-caffeoyl glucose)
  • 陆晨飞 on 丹参酚酸的裂解II(5):1-O-咖啡酰葡萄糖(1-O-caffeoyl glucose)
  • YanZhang on 能否通过单纯IV或IG计算药物体内代谢的比率呢?
  • NICK ZHANG on 用NONMEM实现IV和IG数据的同时分析
  • De-Yang Shen on About

Tags

alpha裂解 C++ Caffeic acid methyl ester ChemDraw Danshensu ESI-MS Fragmentation Pathway matlab NONMEM perl pharsigh phoenix Protocatechuic acid RDA裂解 WInNonLin 丹参 丹参素 人参皂苷 共轭稳定 原儿茶酸 原儿茶醛 反应路径分析 史努比 同位素峰 咖啡酸甲酯 四原环裂解 天然产物 孤对电子 对烯苯醌 建模 沉香 烯醇互变 甘草黄酮 生活所迫 电子云密度 电荷诱导 男追女 群体药动学 色原酮 苯乙基色原酮 菠萝科学奖 裂解途径 质谱解析 酶动力学 高分辨质谱

[藏书千卷不如读书一卷]基于酶和转运体的DDI研究(4)

by Yufeng Zhang on March 15, 2014 at 10:32 pm
Posted In: Informal Essay

Chapter 3
ADME Pharmacogenetics and Its Impact on Drug–Drug Interactions

Abstract

  • CYP酶CYP2B6, CYP2C9, CYP2C19, and CYP2D6和转运体 ABCB1 and OAT1B1具有genetic polymorphisms, 约占人群的1%

3.1 Introduction

  • pharmacogenetics的关注重点已由最开始的药物代谢酶(M),扩展到影响ADE的膜转运体
  • Genetic variants not only determine to which extent a drug is metabolized, taken up or excreted by ADME genes, but they also influence the various mechanisms of how two or more drugs interact with the resulting protein.
  • 某些基因型会直接影响the induction potential of a drug; 通常酶活性的基线水平越低,被诱导剂诱导的越高,但如果absent or low baseline activity是null alleles或其他遗传因素导致的话,就可能会出现不诱导的现象;
  • 遗传多态性对药物代谢酶和转运体对drug exposure的影响的研究很多,直到最近才有少数研究者关注是否这些polymorphisms会改变inter individual susceptibility to or the degree of induction or inhibition.

The role of pharmacogenomics 1

↓ Read the rest of this entry…

 Comment 

[藏书千卷不如读书一卷]基于酶和转运体的DDI研究(3)

by Yufeng Zhang on March 8, 2014 at 1:07 am
Posted In: Informal Essay

Chapter 2
Transporters: Importance in Drug Absorption, Distribution, and Removal

Introduction:transporters的分类

  • SLC (solute carriers, 溶质运载蛋白家族) and ABC (ATP-binding cassette,  ATP结合盒转运载体)
  •  SLC有380多个成员,48个subfamilies,其中约19个gene families的转运活性已被研究,如SLCO, SLC15, SLC22, SLC47
  • 已被鉴定的ABC转运体有7个subfamilies,49个蛋白,一些对药物有特异性,如ABCB, ABCB,and ABCG subfamilies.
  • Tables 2.1和2.2总结了对药物的处置、PK差异、DDI有巨大影响的转运体。
  • Influx/Efflux transporters: ABC都属于Efflux; 很多SLC属于influx,一些SLC是efflux或双向
  • Absorptive/Secretory transporters: 根据转运药物的方向是向着体循环,还是离开体循环进入bile, urine or gut lumen
ABC transporters Mechanism

ABC transporters Mechanism

 

↓ Read the rest of this entry…

 Comment 

能否通过单纯IV或IG计算药物体内代谢的比率呢?

by Yufeng Zhang on March 7, 2014 at 11:59 pm
Posted In: Informal Essay

问题:假定药物在体内是一室分布,通过IV或IG给药,同时测定parent和metabolite随时间变化的浓度(摩尔浓度),能否根据这些数据计算出药物代谢的比例,即有多少百分比的药物生成了代谢产物!

有人建议通过计算代谢物与原型药物峰面积的比值,来估算生成代谢物的比率。Metabolism Rate (MR%) = 100*AUC_m/(AUC_m+AUC_p)

QQ20140309-1

↓ Read the rest of this entry…

1 Comment

[藏书千卷不如读书一卷]基于酶和转运体的DDI研究(2)

by Yufeng Zhang on March 2, 2014 at 8:08 pm
Posted In: Informal Essay

Chapter 1: Enzymatic Basis of Phase I and Phase II Drug Metabolism

本章综述一相和二相解毒酶,它们潜在的诱导和抑制功能,以及基因改变在DDI中的角色。

  • 人体内的酶种类繁多,普遍存在polymorphisms;基因水平的改变会影响药物的处置和DDI,这通常被成为idiosyncratic drug reactions (特异性药物反应)。
  • 代谢酶分为Phase I和Phase II,Phase I主要为CYP酶系,除了肝脏外,其他肠道等器官的分布也很重要;
  • Phase II有UGTs, SULTs, GSTs and NATs.
  • FDA批准的药物有60%是CYP酶系代谢的
  • Fig.1.1 为CYP450的通用代谢过程图。

QQ20140302-3

↓ Read the rest of this entry…

 Comment 

[藏书千卷不如读书一卷]基于酶和转运体的DDI研究(1)

by Yufeng Zhang on March 1, 2014 at 5:31 pm
Posted In: Informal Essay

去年(2013年)我在空余时间读完了14本书,其中5本为英文原著,不过多是一些科普、宗教和小说类的书籍,今年想把自己计划阅读的书单偏重于专业书。专业书多为七八百页,甚至上千页的大部头,给自己的要求是,不仅要看,还要做好每章内容的摘要和笔记。我相信一个看法,只有用自己的话,把书中的内容写出来,才算学到了东西。第一本书,我选择的是“Enzyme- and Transporter-Based Drug–Drug Interactions”,书相当于一系列主题的综述,多是事实性的内容,有助于增加自己在DDI方面的知识面和系统性。我争取每周读一章,并摘录要点。

Layout 1

 

↓ Read the rest of this entry…

2 Comments
  • Page 2 of 19
  • «
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • »
  • Last »

Recent Posts

  • Elucidation of Interaction Mechanisms between Irinotecan and Oroxylin A in Rats through Physiologically Based Pharmacokinetic Modeling
  • Postdoc positions available at CUHK, Hong Kong 香港中文大学博士后岗位
  • 质谱(Mass Spectrometry, MS)与药学研究 (8)
  • 质谱(Mass Spectrometry, MS)与药学研究 (7)
  • 质谱(Mass Spectrometry, MS)与药学研究 (6)
December 2023
M T W T F S S
« Sep    
 123
45678910
11121314151617
18192021222324
25262728293031

Categories

  • Informal Essay
  • Mass Spectrometry
  • Modeling & Simulation
  • Uncategorized

Archives

  • September 2023
  • February 2019
  • April 2014
  • March 2014
  • February 2014
  • January 2014
  • December 2013
  • September 2013
  • August 2013
  • July 2013
  • May 2013
  • September 2012
  • October 2010
  • November 2007

©2007-2023 MS Blog of Dr. Zhang | Powered by WordPress with ComicPress | Subscribe: RSS | Back to Top ↑