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Some thoughts on Mass Spectrometry and Modeling & Simulation
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Transit Compartment Model vs LAG Model (转移室模型与时滞模型)

by Yufeng Zhang on February 28, 2014 at 4:49 pm
Posted In: Modeling & Simulation

有些口服药物在到达吸收部位前,在消化道内转运需要一段时间,这在PK曲线上,就会看到血药浓度在某某min以后才会开始上升。传统的处理方法(也是现在 主要药动学软件都内置的)是增加一个时滞参数TLAG。加上TLAG以后一般会得到较好的拟合结果,不过,从理论上分析,药物不能在TLAG以后,突然开 始吸收入血,肯定有个变化的过程。见下图的模拟,虚线是LAG模型,实线是TRANSIT模型:

QQ20140302-2

 

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一个用Gaussian计算溶剂中ECD光谱的方法来确定化合物绝对构型的实例

by Yufeng Zhang on February 27, 2014 at 7:54 pm
Posted In: Modeling & Simulation

本文的例子是我们在研究鬼箭羽时发现的一个新化合物,当时其绝对构型采用经验规则与已知绝对构型的进行比较来确定的,发表在Natural Product Research上。后来,我们采用量化计算的方式,同样的确定了该化合物的绝对构型,下面详细的笔记,与诸位分享。 ↓ Read the rest of this entry…

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用NONMEM实现IV和IG数据的同时分析

by Yufeng Zhang on February 25, 2014 at 11:23 pm
Posted In: Modeling & Simulation

学过药动的人都知道生物利用度(F)是一个非常重要的参数,其反映了机体对药物的利用程度。Wikipedia上对生物利用度(Absolute bioavailability)的解释为:

In pharmacology, in order to determine absolute bioavailability of a drug, a pharmacokinetic study must be done to obtain a plasma drug concentration vs time plot for the drug after both intravenous (iv) and extravascular (non-intravenous, i.e., oral) administration. The absolute bioavailability is the dose-corrected area under curve (AUC) non-intravenous divided by AUC intravenous. For example, the formula for calculating F for a drug administered by the oral route (po) is given below.

65cae8c6de6959917d6e7475814f6af2

那个这个生物利用度F是否可以认为是当药物口服的时候,进入体内的药物的百分比呢?即当生物利用度为10%,给药剂量为100mg时,那么进入体内的总药物量就是10mg。

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└ Tags: Bioavailability, NONMEM, PK
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质谱(Mass Spectrometry, MS)与药学研究 (5)

by Yufeng Zhang on January 18, 2014 at 11:00 am
Posted In: Informal Essay

缘何碎片质更高
反常里面藏玄妙

质谱是一门试验科学,而试验科学的精髓就是尊重试验的结果,这一点是我们搞试验人员必须时刻要牢记的。“试验”不是“实验”,你要不断的去尝试,尤其是别人没有尝试过的东西(包括动手的尝试和动脑的尝试),而不是总重复别人,如给本科生上实验课一样。如何才能体现对试验的尊重呢?!千万不要用自己已知的经验去限定未知的试验现象,这可能也是专家(这里特指那些只会吹嘘,没有实践经验的人,不要对号入座。)的思想一般都比较顽固的缘故吧。专家的头脑中有过多的思维定式,遇到问题多是从自己以往的经验去判断,如果不符合自己的经验,就会下结论“你做的试验有问题,重做!”。 ↓ Read the rest of this entry…

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[2005-05-03]预则立,不预则废(昔日博士阶段的规划)

by Yufeng Zhang on January 5, 2014 at 11:02 am
Posted In: Informal Essay

整理文件,看到一篇自己在2005年写的一个计划,希望在博士三年中在“内在修养、健康体魄、事业有成”三个方面有所进步。现在看来,有些东西不仅是博士三年要做的,也是我一生要继续努力的。下面红色的为自己今天的注释,其他为原版的文字,为了保持原样,错别字也没有修改。原始的文档保存在QQ收藏夹中,得以这么多年以后,还可以看到。

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