丹参酚酸的裂解II(13):咖啡酸甲酯 (caffeic acid methyl ester)

咖啡酸甲酯的裂解途径 前面解析过的咖啡酸甲酯的质谱图看着很别扭,而本文中的质谱数据却比较好看。在二级质谱图中,推测咖啡酸甲酯在环境中水的作用下,脱去甲基,生成咖啡酸m/z 179,其后裂解应与咖啡酸相同,但是与之间的结果比较后,发现此处的m/z 179可以生成m/z 161,但咖啡酸的二级质谱图中却没有m/z 161,点解呢?我觉得这是电荷位点不同造成的结果,咖啡酸甲酯的电荷只能在苯环的酚羟基上,生成的咖啡酸m/z 179的电荷也在酚羟基上,这时羧基上有氢,可以脱水生成m/z 161;而咖啡酸的电荷在羧基上,带负点以后,就没有氢了,不能脱水啦。你哋明咗否? 化合物:Names from NCI| PubMed 分子量:194.2 分子式:C10H10O4 SMILES: OC(C=C1)=C(O)C=C1/C=C/C(OC)=O InChIKey: OCNYGKNIVPVPPX-HWKANZROSA-N 参考文献: 10.1002/pca.1272 质谱数据: MS2:179(100),161(18); MS3:161(100),135(48) –EOF– 文章来自,微信号:MS4Fun,网站: msky.in,每天解析一个天然产物的质谱数据或分享自己在建模方面的心得。

丹参酚酸的裂解II(12):丹酚酸F (salvianolic acid F)

丹酚酸F的裂解途径 丹酚酸F为咖啡酸的二聚体,主要在上图所示的位置发生断裂,脱去羧基,或者3,4-二羟基苯乙烯。脱去羧基时,其上的活泼氢转移到乙烯上,这个过程较容易;而脱3,4-二羟基苯乙烯时,需要将乙烯上的氢转移到苯环上,能量需求较高,所以在二级谱中看到m/z 135并不太高,在三级中才是基峰。 化合物:Names from NCI| PubMed 分子量:314.3 分子式:C17H14O6 SMILES: C1=CC(=C(C=C1/C=C/C2=C(C=CC(=C2O)O)/C=C/C(=O)O)O)O InChIKey: PULWRMOKQNWQBD-LZSLGQGWSA-N 参考文献: 10.1002/pca.1272 质谱数据: MS2:269(100),179(98),135(38); MS3:135(100) –EOF– 文章来自,微信号:MS4Fun,网站: msky.in,每天解析一个天然产物的质谱数据或分享自己在建模方面的心得。

丹参酚酸的裂解II(11):丹酚酸I (salvianolic acid I)

丹酚酸I的结构中有一咖啡酸单元接在另一个咖啡酸的苯环的对位,若是接在这个位置,则很难失去丹参素单元,因此二级质谱图中生成m/z 339是不合理的。据此推测,文中将其归属为丹酚酸I不妥,应该是丹酚酸H。在以前的文章中,我们已经解析了丹酚酸H,当时的文章中也没有确定到底是丹酚酸H,还是丹酚酸I,今天意识到,这两个篇文章中提到的化合物,都应是丹酚酸H。 化合物:Names from NCI| PubMed 分子量:538.5 分子式:C27H22O12 SMILES: OC(C(CC1=CC=C(C(O)=C1)O)OC(/C=C/C2=CC=C(C(O)=C2)O/C(C(O)=O)=C\C3=CC(O)=C(C=C3)O)=O)=O InChIKey: MZSGWZGPESCJAN-JKXXRSRDSA-N 参考文献: 10.1002/pca.1272 质谱数据: MS2:493(60),339(100),295(46); MS3:295(100) –EOF– 文章来自,微信号:MS4Fun,网站: msky.in,每天解析一个天然产物的质谱数据或分享自己在建模方面的心得。

丹参酚酸的裂解II(10):菊苣酸(cichoric acid)

菊苣酸的裂解途徑 菊苣酸是2,3-二羟基琥珀酸与两分子咖啡酸成酯的衍生物,结构中的内酯键是主要的断裂位点,如上图所示。 文献中的yunnaneic acid D/F的结构比较特殊,还没有找到其结构的裂解规律,暂时搁置一下。 化合物:Names from NCI| PubMed 分子量:474.4 分子式:C22H18O12 SMILES: C1=CC(=C(C=C1/C=C/C(=O)O(C(=O)O)(OC(=O)/C=C/C2=CC(=C(C=C2)O)O)C(=O)O)O)O InChIKey: YDDGKXBLOXEEMN-IABMMNSOSA-N 参考文献: 10.1002/pca.1272 质谱数据: MS2:437(11),311(100),293(53); MS3:179(31),149(100) –EOF– 文章来自,微信号:MS4Fun,网站: msky.in,每天解析一个天然产物的质谱数据或分享自己在建模方面的心得。

丹参酚酸的裂解II(8):阿魏酰酒石酸酯(fertaric acid)

阿魏酸酒石酸酯的裂解途径 该化合物比昨天的化合物多一个甲基而已,其MS2中有生成m/z 113,比较合理,推测多半是作者把数据拷贝错了。 化合物:Names from NCI| PubMed 分子量:326.3 分子式:C14H14O9 SMILES: O=C(O(C(O)=O)(O)C(O)=O)/C=C/C1=CC(OC)=C(O)C=C1 InChIKey: XIWXUSFCUBAMFH-WEPHUFDCSA-N 参考文献: 10.1002/pca.1272 质谱数据: MS2:193(100),113(7); MS3:179(100),149(66) –EOF– 文章来自,微信号:MS4Fun,网站: msky.in,每天解析一个天然产物的质谱数据或分享自己在建模方面的心得。

假如宋王台真的可以穿越时空

越古老的东西,我们越相信它有灵性,如若没有灵性,怎可以在岁月的长河中生存下来呢!有些事情我宁愿相信它的存在,即便没有任何证据,比如穿越到古代。在未知的事物面前,我想人应该有所敬畏,而不是一味用所谓科学的眼光去评价。我们生活的这个世界可以没有科学,但是没有了非科学,人类就不成其为人类了。所谓非科学,就是指所有科学以外的学科,比如哲学、宗教、人文等。在我们人类的历史长河中,大部分人是一生都没有接触过科学的。太相信科学只是一种现代的迷信吧了,还不如相信人可以穿越时空~ 《情逆三世缘》真是一个很好的故事,我总是纳闷,为什么有人可以想出这么好的故事呢?会讲故事真是一个了不起的本领,虽然听的人知道它都是满口瞎话,仍然愿意听,这是一种多么神奇的能力!时间一晃,几十年就过去了,如果可以穿越到16年前,那将多好啊!但也可能我知道有些事必然会发生,只是无力改变,最终又重走以前的老路,那样更让人绝望吧~ 我的思绪又回到了现代,穿越与否不是关键,关键是我们对世事无常感觉极其绝望,想找个逃避的理由罢了。孙悟空也曾有这种绝望,多次穿越,也改变不了结果,最应该改变的该是自己啊!人的那个本心、初心,就在那里,一切频繁复杂的乱想,最根本的都在那一点,从没改变,不仅今生今世,更有可能前世、前前世,后世、后后世,都没有改变。本心被幻想所迷惑,绝大部分时间都不曾意识到自己还有本心,认幻为真,可悲可叹! 周末去宋王台看下,待续。

我是盗版软件的受害者

我2001年的时候正值年少,精力充沛,感觉自己没有做不成的事,只要自己想做。但在那个信息极端闭塞的北方学校,贫乏的资源让我对外界有着极端的渴望,在那个环境下,要想靠循规蹈矩获得需要的东西是不可能的。当时的网速还很慢,互联网上资源还很少,而我们的那个图书馆还在靠体力来查化学文摘。要突破现有的限制,只有借助非常规手段。 所以当时对破解软件的cracker和网络技术大牛hacker都很崇拜,自己的初衷是希望学习这些可以获得更多的接触新东西的机会,让自己不落后于时代的发展。有了这一个冠冕堂皇的理由,我全然投入到了这个对于药学学生完全不熟悉的领域。多少个夜晚,在Softice上追踪程序,用ProxyHunter扫描代理,更加上网络上认识的一群臭味相投的狐朋狗友,那个自大的我膨胀的厉害!一时间,与自己专业相关的软件都被破了,各种专业数据库也都可以自由进出了,可结果怎样呢?除了炫耀一下,对自己的事业帮助实在有限。然而自己却失去了很多发展的机会,往事不堪回首,当年的后遗症仍在时时刺痛我,折磨我!易得的东西不会珍惜,自己到底使用了那些软件的多少功能,为自己创造了那些便利?对自己的科研有何帮助?难道没有那些就不可吗?我用一个比喻来描述我的状况:面前有一条小溪,水深正好没过膝盖,我们的目的是过河去摘苹果。我是怎么做的呢?!花1年时间学习造船技术,花2年时间造了一艘完美的船,后来发现水太浅,大船不能航行,于是给船加上轮子,使之具有水路两栖功能,浩浩荡荡的过了小溪,觉得丢掉船太可惜了,于是背在身上去摘苹果,可想而知,每前进一步都非常辛苦,辛苦的都会常常忘记自己的初衷。我曾苦叹,为什么没有大海让我扬帆远航?但真到了大海,我能航行多久呢?自己的船是否能经受风浪的冲击?一切还都是未知数!为了破而破,而不考虑自己眼前是否需要,总觉得将来的时间还很多,其实不知不觉之中,你才发现原来已经没有多少时间了。如果自己比较笨,学不会那些技术,也许我现在过得会更顺利一些。如果上天再给我一次重来的机会,我会花更多的时间与参与社团活动,去学习和运用英文,即便是用来追女孩,也不枉此生。 从今以后,我将远离盗版软件,逐步用正版或开源、免费的工具代替,比如用R代替matlab,mac (or linux)代替Windows等等!关闭不该开的窗,该开的窗自会呈现! –EOF– 文章来自,微信号:MS4Fun,网站: msky.in,每天解析一个天然产物的质谱数据或分享自己在建模方面的心得。

丹参酚酸的裂解II(7):咖啡酰酒石酸(caftaric acid)

咖啡酰酒石酸的裂解途径 我觉得文献给出的数据有点乱,其中m/z 113应该是由m/z 311生成的,而不是由m/z 179生成的,或者是作者拷贝数据的时候错了,或者是离子残留造成的。m/z 为酒石酸的特征离子。 化合物:Names from NCI| PubMed 分子量:312.2 分子式:C13H12O9 SMILES: O=C(O(C(O)=O)(O)C(O)=O)/C=C/C1=CC(O)=C(O)C=C1 InChIKey: SWGKAHCIOQPKFW-JTNORFRNSA-N 参考文献: 10.1002/pca.1272 质谱数据: MS2:179(100); MS3:135(100),113(8) –EOF– 文章来自,微信号:MS4Fun,网站: msky.in,每天解析一个天然产物的质谱数据或分享自己在建模方面的心得。

丹参酚酸的裂解II(6):原儿茶醛(protocatechuic aldehyde)

原儿茶醛的裂解 原儿茶醛生成m/z 91,初看真不好解释,查看文献,发现邹教授报道的文中,原儿茶醛生成m/z 109的碎片,这个比较好理解,而m/z 91相当于再脱一分子水,是否能在这种Agilent的离子阱中产生呢?为什么没有观测到m/z 109,值得去推敲。 化合物:Names from NCI| PubMed 分子量:138.1 分子式:C7H6O3 SMILES: O=CC1=CC=C(O)C(O)=C1 InChIKey: IBGBGRVKPALMCQ-UHFFFAOYSA-N 参考文献: 10.1002/pca.1272 质谱数据: MS2:91(100) –EOF– 文章来自,微信号:MS4Fun,网站: msky.in,每天解析一个天然产物的质谱数据或分享自己在建模方面的心得。

丹参酚酸的裂解II(5):1-O-咖啡酰葡萄糖(1-O-caffeoyl glucose)

1-O-咖啡酰葡萄糖的裂解途径 中性丢失162Da,有可能是脱水葡萄糖,也有可能是脱水咖啡酸,这时就需要根据化合物的极性去判断了,一般葡萄糖苷的极性较大,保留时间短,再结合其他周围的化合物,即可判断。 化合物:Names from NCI| PubMed 分子量:342.3 分子式:C15H18O9 SMILES: O=C(O1O(CO)(O)(O)1O)/C=C/C2=CC=C(O)C(O)=C2 InChIKey: WQSDYZZEIBAPIN-SKTDOXOGSA-N 参考文献: 10.1002/pca.1272 质谱数据: MS2:179(100); MS3:179(52),135(100) –EOF– 文章来自,微信号:MS4Fun,网站: msky.in,每天解析一个天然产物的质谱数据或分享自己在建模方面的心得。