基于pybel的在线化合物属性计算程序
Yufeng Zhang
在每天的裂解途径解析的时候，最后都要给出对应的化合物的结构信息，比如分子量、分子式等，每个化合物都要放到ChemDraw中去计算，然后再拷贝回来，效率低下，还比较容易出错。一直想写个在线的计算程序，输入SMILES，然后输出想要的结构性质和结构式，今天终于得空写好。
August 2013
甘草黄酮的裂解(15)：欧甘草素B（Hispaglabridin B）
还是觉得这种有放射背景的图更好看一些，一切看心情吧。今天是甘草黄酮系列的最后一个化合物欧甘草素B，比前天的欧甘草素A多一个不饱和度。负离子中最高的为B1,3+离子m/z 201，这个质荷比是不是在好多甘草黄酮中都见过？
甘草黄酮的裂解(14)：3-羟基光甘草醇（3-hydroxy-glabrol）
3-羟基光甘草醇属于二氢黄酮醇，结构上仅比前面介绍的光甘草醇在3位多一个羟基，不用想也知它们的裂解途径很相似。在负离子模式下，C环开裂生成A1,3+(m/z 203)，并进一步失去CO2得到m/z 159。理论上还应该看到电荷在B环的B1,3+离子（m/z 203），但它的质荷比正好与A1,3+相同，是不是我们观测到的m/z 203为这两种离子的混合物呢？
甘草黄酮的裂解(13)：欧甘草素A（Hispaglabridin A）
欧甘草素A比光甘草定的母核相同，仅在3‘位多一个异戊烯基，它的正负离子质谱图的主要裂解途径与光甘草定一致，相同的裂解途径可以参考以前的文章，此处不再详述。
甘草黄酮的裂解(12)：4′-O-甲基光甘草定（4′-O-methylglabridin）
新版ChemDraw终于支持元素颜色标记了，同时调整了一下线条的粗细和背景，现在看起来自我感觉很不错，非常像ChemWriter的style。
甘草黄酮的裂解(11)：3′-羟基-4′-O-甲基光甘草定（3′-Hydroxy-4′-O-methylglabridin）
首先对于裂解途径图中的一些默认设定再说明一下：(1)绿色背景为负离子模式，黄色背景为正离子模式;(2)质谱图中观测到的离子碎片的结构在裂解图中标注为“m/z ***”，如果结构下面没有，则表示其为裂解中间体（中括号省略了）;(3)中性丢失碎片的标注为“NL: ***Da”;(4)结构上的单边箭头表示转移单电子，双边箭头表示转移一对电子;(4)不同碎片结构间的箭头指明裂解的过程，如果是双向箭头，则这两个结构是可以互变的。
甘草黄酮的裂解(10)：光甘草醇（Glabrol）
已经连续4天是光甘草某某了，虽然名字上仅差一个字，但结构上差别还是很大的，不仅是一个酮或醇的差别。光甘草醇（其实一般酚羟基不叫醇的，这个名字起的，有点那个，还不如叫光甘草酚）在A和B环上各有一个酚羟基，酸性都较强，均可丢失活泼氢而带负电荷，所以当C环发生1,3-断裂（这里也叫逆迪尔阿泽反应，RDA）后，根据电荷位点的不同，生成m/z 203和187。
甘草黄酮的裂解(9)：光甘草定（Glabridin）
早晨匆忙上班，发现大街上空荡荡的，走到地铁口，看到8号风球的警报，才知道上午不用上班了。昨天七夕，各路神仙都在发表对七夕的各种看法，即便生孩子的、加班的、甚至已到中年的也不例外。而我呢，给自己点了一套大餐，美美吃一顿，然后该干啥干啥。昨晚本想出去跑步，后来没去，好吧，雨中跑步确实显得有点过分哦。
甘草黄酮的裂解(8)：光甘草酮（Glabrone）
这类黄酮的解析真不简单，每天都要花我一个小时的时间，有点超出预期。下个系列一定选个简单点的，争取在15分钟内全部搞定。光甘草酮属于异黄酮，但C环开裂的离子丰度不高，如负离子模式中的m/z 213和正离子模式中的m/z 137，主要碎片与C环上的羰基和成环的异戊烯基有关。
甘草黄酮的裂解(7)：光甘草素(Glabrene)
光甘草素属于异黄烷－3-烯，同时B环上有一个环合的异戊烯单元，但它没有异戊烯的特征碎片离子m/z 56或42，这与其特殊的结构有关。在原来的文章中，作者虽然号称在补充材料中给出了其裂解途径，我感觉他只是虚晃一枪而已，